主に次のような機能があります。まず、読み込んだデータの断面図を描くことが可能です。断面図の上に等高線や等値面が描けます。さらに補助図形を描き入れることもでき、補助図形には画像を貼り付けることが可能です。そのほかにも座標軸や背景の設定を変えたり、現在のデータの設定を保存し、次回開いたときに現在の状態にすばやく切り替えることができます。

「GLGraph」では、データファイルの読み込み部分をプラグインとして独立させ、そのソースコードを公開しているため、さまざまなファイル形式に柔軟に対応することができるようになっています。